Зачёт переплаты в счёт доначислений при ВНП — VINDEX

Зачёт переплаты в счёт доначислений при ВНП

Зачёт переплаты в счёт доначислений при выездной налоговой проверке — это механизм, при котором сумма налога, ранее излишне уплаченная в бюджет, засчитывается в погашение недоимки, доначисленной по итогам ВНП. Если собственник компании уверен, что возражения на акт проверки сработают, он нередко упускает этот инструмент: переплата остаётся на счёте, а доначисление растёт вместе с пенями. По данным ФНС за 2024 год, средний размер доначислений по одной результативной ВНП составил 65 млн рублей по России — и в каждом из этих дел вопрос о зачёте решает, будет ли взыскание принудительным.

Материал написан для собственника, компания которого находится под ВНП или уже получила акт с доначислениями. Ниже — как работает зачёт по нормам НК РФ, когда ИФНС обязана его провести, как возражения на акт влияют на расчёт пеней и что делать, если инспекция игнорирует переплату при вынесении решения.

Как зачёт переплаты работает в рамках ВНП

Статья 78 НК РФ устанавливает общий порядок зачёта излишне уплаченного налога. Применительно к ВНП механизм выглядит так: если на дату вынесения решения по итогам проверки у компании числится переплата по тому же или иному налогу, ИФНС обязана учесть её при определении итоговой суммы к уплате. Переплата уменьшает недоимку, а не просто висит на лицевом счёте как абстрактный актив.

На практике ИФНС нередко этого не делает. Инспекция фиксирует полный размер доначисления в решении, а переплату предлагает зачесть отдельным заявлением — уже после вступления решения в силу. Разница существенная: пени начисляются на полный размер недоимки вплоть до момента фактического зачёта, а не с даты, когда переплата фактически перекрывала долг.

Пленум ВАС РФ в постановлении от 30.07.2013 № 57 разъяснил: при наличии переплаты по соответствующему налогу основания для привлечения налогоплательщика к ответственности по статье 122 НК РФ отсутствуют. Это принципиальный тезис — переплата не просто снижает сумму к уплате, она блокирует штраф, если перекрывает доначисление на дату окончания срока уплаты налога за проверяемый период.

Срок давности по статье 113 НК РФ составляет три года. Это означает, что ИФНС не вправе доначислить налог за периоды, выходящие за трёхлетнюю глубину проверки. Однако переплата за «старые» периоды может участвовать в зачёте, если она не утрачена по сроку возврата.

Когда возражения на акт не отменяют необходимость зачёта

Главное возражение собственника в этой ситуации звучит так: «Мы уже подали возражения на акт — думаем победим». Это рабочая позиция, но она не отменяет финансовую логику зачёта. Рассмотрим, почему.

Возражения на акт ВНП подаются в течение одного месяца с даты получения акта (пункт 6 статьи 100 НК РФ). Этот срок не восстанавливается. ИФНС рассматривает возражения и выносит решение. До момента вынесения решения доначисление не взыскивается, но пени продолжают начисляться на недоимку — независимо от того, поданы возражения или нет.

Если переплата существует и перекрывает доначисление хотя бы частично, каждый день без зачёта — это прямые потери. Пеня по текущей ставке составляет примерно 1/300 ключевой ставки ЦБ РФ за каждый день просрочки. При доначислении 65 млн рублей и ключевой ставке 21% годовых ежедневные пени превышают 45 000 рублей. За три месяца рассмотрения возражений — более 4 млн рублей только на пенях.

Результативность ВНП в 2024 году составила 97,8%. Это значит: из каждых 100 проверок 98 завершаются доначислениями. Возражения снижают сумму — иногда существенно, — но полностью отменяют решение значительно реже. Рассчитывать только на победу по возражениям при наличии переплаты — значит намеренно увеличивать финансовые потери.

Получили акт выездной проверки с доначислениями?

Если ИФНС вручила акт ВНП — у вас один месяц на подачу возражений (пункт 6 статьи 100 НК РФ). Этот срок не восстанавливается. Параллельно необходимо оценить, есть ли переплата, способная заблокировать штраф по статье 122 НК РФ и остановить начисление пеней. Юристы VINDEX проанализируют основания доначислений и подготовят возражения с правовой аргументацией — с одновременной проверкой лицевого счёта на наличие переплаты.

Оспорить выводы налоговой

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram

Как ИФНС обязана учитывать переплату при вынесении решения?

Порядок вынесения решения по итогам ВНП определён статьёй 101 НК РФ. Решение выносится в течение десяти рабочих дней после окончания срока на подачу возражений и может продлеваться ещё на один месяц. В решении фиксируются: сумма недоимки, размер пеней и штрафы.

Позиция судебной практики, закреплённая в Постановлении Пленума ВАС РФ № 57 от 30.07.2013, такова: наличие переплаты по тому же налогу на дату окончания срока его уплаты исключает состав правонарушения по статье 122 НК РФ. Иными словами, штраф 20% (а при умысле — 40%) не должен начисляться, если переплата перекрывала недоимку в соответствующий период.

Если ИФНС включила штраф в решение, проигнорировав переплату, это самостоятельное основание для отмены решения в этой части — как в УФНС через апелляционную жалобу, так и в арбитражном суде. Апелляционная жалоба подаётся через ИФНС, вынесшую решение, в течение одного месяца до его вступления в силу (статья 139.1 НК РФ).

Обеспечительные меры — блокировка счетов по статье 76 НК РФ — принимаются после вступления решения в силу. Если зачёт проведён до этого момента и недоимка погашена, оснований для блокировки по обеспечению исполнения решения нет.

Зачёт переплаты при дроблении и налоговой реконструкции

Отдельный случай — ситуация, когда доначисление связано с дроблением бизнеса или применением статьи 54.1 НК РФ. В этих делах ИФНС консолидирует выручку группы компаний и доначисляет налоги «как если бы» все операции шли через одно юридическое лицо на ОСН.

Обзор практики ВС РФ от 13.12.2023 закрепил позицию: при консолидации доходов группы ИФНС обязана учесть налоги, уже уплаченные участниками группы на спецрежимах (УСН, ЕНВД). Это прямой аналог зачёта переплаты — уплаченный УСН засчитывается в счёт доначисленного налога на прибыль и НДС. Без этого зачёта итоговая сумма доначислений завышена, и именно на её основе рассчитываются штрафы.

На практике ИФНС нередко не проводит такой зачёт самостоятельно. Налогоплательщик должен заявить его явно — в возражениях на акт или в апелляционной жалобе. Если этого не сделать до вынесения решения, арбитражный суд вправе учесть переплату, однако это удлиняет процесс и увеличивает пени.

Три сценария для собственника: от переплаты к итоговой сумме взыскания

Сценарий 1. Переплата перекрывает доначисление полностью

Ситуация: у компании числится переплата по налогу на прибыль, ИФНС доначисляет налог на прибыль по тому же периоду. Переплата перекрывает недоимку на дату окончания срока уплаты налога. Ключевые доказательства: выписка из КРСБ, сопоставление дат. Вероятный исход: штраф по статье 122 НК РФ не начисляется (Пленум ВАС № 57), пени минимальны. Стратегия: подать заявление о зачёте до вынесения решения и включить довод об отсутствии штрафа в возражения на акт.

Сценарий 2. Переплата перекрывает доначисление частично

Ситуация: собственник холдинга, ИФНС доначислила 80 млн рублей НДС, переплата по НДС — 25 млн рублей. Ключевые доказательства: КРСБ, заявление о зачёте с указанием конкретных КБК и периодов. Вероятный исход: переплата зачтена в счёт 25 млн рублей, штраф 20% начисляется только на оставшиеся 55 млн рублей (то есть 11 млн, а не 16 млн рублей). Пени снижаются пропорционально. Стратегия: активировать зачёт немедленно, параллельно оспаривать основания доначисления по существу.

Сценарий 3. Переплата по одному налогу, недоимка по другому

Ситуация: переплата по налогу на прибыль, доначисление по НДС. По общему правилу зачёт между разными налогами возможен в пределах федерального бюджета — и налог на прибыль, и НДС являются федеральными налогами. Ключевые доказательства: заявление в ИФНС с указанием на зачёт в соответствии со статьёй 78 НК РФ, выписка КРСБ. Вероятный исход: при корректном заявлении ИФНС обязана провести зачёт; отказ обжалуется в суде. Стратегия: не ждать инициативы инспекции — заявление подаётся письменно с описью.

Получили решение о доначислении — и есть переплата?

Если компания получила решение по ВНП, а на лицевом счёте числится переплата — апелляционная жалоба в УФНС подаётся в течение одного месяца (статья 139.1 НК РФ). После истечения этого срока решение вступает в силу, и ИФНС вправе заблокировать счета. Юристы VINDEX оценят перспективы апелляционного обжалования в УФНС и арбитражном суде, подготовят жалобу с доводом о зачёте переплаты.

Обжаловать доначисление ФНС

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram

Из практики

Приволжский ФО, осень 2023. Собственник производственной группы получил акт ВНП с доначислениями по НДС на 47 млн рублей. На лицевом счёте числилась переплата по налогу на прибыль — 19 млн рублей. ИФНС не учла переплату при расчёте штрафа: начислила 20% на полную сумму доначисления (9,4 млн рублей). В возражениях на акт был заявлен довод о зачёте со ссылкой на Постановление Пленума ВАС РФ № 57. ИФНС частично согласилась: штраф пересчитан на недоимку за вычетом перекрытой переплатой части — итоговый штраф снижен до 5,6 млн рублей.

Центральный ФО, весна 2024. Бенефициар холдинга из трёх компаний на УСН получил решение о доначислении по консолидированной группе — НДС и налог на прибыль на общую сумму 112 млн рублей. ИФНС не зачла уплаченный участниками группы налог по УСН за три года — около 28 млн рублей. Арбитражный суд первой инстанции, руководствуясь позицией Обзора ВС РФ от 13.12.2023, обязал ИФНС учесть уплаченный УСН при расчёте недоимки. Итоговая сумма к уплате снизилась до 84 млн рублей, штраф пересчитан.

Направления практики по теме

Смотрите также: Добросовестность до ВНП — что создать заранее, Обжалование отказа в возмещении НДС в суде, Сопровождение налоговой реконструкции.

Частые вопросы

1. Сколько длится ВНП?

Выездная налоговая проверка длится два месяца со дня вынесения решения о её проведении. Срок может быть продлён до четырёх месяцев, а в исключительных случаях — до шести (статья 89 НК РФ). Дополнительно проверка может приостанавливаться на срок до шести месяцев: на период истребования документов у контрагентов или проведения экспертизы. Фактически ВНП с учётом приостановлений нередко растягивается на год и более.

2. Можно ли приостановить ВНП?

Приостановить проверку вправе только ИФНС — по собственному решению, например для истребования документов у иностранных государственных органов или проведения экспертизы. Налогоплательщик не имеет права требовать приостановления. Однако в период приостановления ИФНС не вправе истребовать у компании документы и проводить действия на её территории — это фактически даёт передышку для подготовки позиции.

3. Что проверяет ФНС?

В ходе ВНП инспекция проверяет правильность исчисления и своевременность уплаты налогов, указанных в решении о проведении проверки, за период не более трёх лет. Наиболее часто предметом ВНП становятся НДС (около 60% доначислений) и налог на прибыль (около 30%). Отдельно проверяются реальность хозяйственных операций и соответствие структуры бизнеса критериям статьи 54.1 НК РФ.

4. Как подготовиться к ВНП?

Подготовка начинается до получения решения о назначении проверки — в рамках предпроверочного анализа. Необходимо оценить налоговую нагрузку по отраслевым показателям, проверить контрагентов на признаки технических компаний, привести в порядок первичную документацию и согласовать с сотрудниками порядок взаимодействия с инспекторами при допросах. Компания, которая ждёт уведомление без подготовки, теряет преимущество в первые же дни проверки.

5. Когда ФНС назначает выездную проверку?

ФНС назначает ВНП по результатам предпроверочного анализа, который включает оценку налоговой нагрузки, рентабельности и удельных показателей по отрасли. Триггерами служат: низкая налоговая нагрузка относительно среднеотраслевой, убытки в течение двух и более налоговых периодов, высокая доля вычетов по НДС. По данным ФНС за 2024 год, результативность проверок составляет 97,8% — ИФНС назначает проверку только при наличии сформированной доказательной базы.

Зачёт переплаты в счёт доначислений при ВНП — не технический вопрос бухгалтерии. Это инструмент снижения финансовых потерь, который работает только при своевременном заявлении: в возражениях на акт или до вынесения решения. Упущенный зачёт увеличивает пени и расширяет базу для штрафа. Возражения на акт и зачёт переплаты — не альтернативы, а параллельные действия.

VINDEX сопровождает налоговые споры на всех стадиях: от получения акта ВНП до арбитражного суда. В делах с доначислениями по дроблению и реконструкции анализ переплаты входит в стандартную проверку позиции на начальном этапе.

Есть ситуация с налоговой, которую хотите разобрать?

Оценим риски и скажем, можем ли быть полезны. Рейтинг Право-300 · 15+ лет практики сети.

Оценить налоговые риски

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram  |  info@vitvetbiz.ru

Автор статьи

Артём Борисов, аналитик-эксперт

Специализация — налоговые споры в арбитражных судах: апелляция, кассация, представительство в ФАС округов и ВС РФ. Формирует процессуальную стратегию по делам с суммой доначислений от 50 млн рублей.

5 июля 2026 года