Лицензии и разрешения при ВНП

Почему лицензии и разрешения оказываются в центре ВНП?

Лицензируемые виды деятельности — это строительство, медицина, фармацевтика, образование, транспорт, охрана и ряд других. Для них НК РФ предусматривает специальные условия признания расходов, применения льгот по НДС и права на пониженные тарифы страховых взносов. ИФНС проверяет: действительно ли компания вела именно ту деятельность, которая указана в лицензии, и именно в тот период, за который заявлены льготы.

Расхождение хотя бы по одному параметру даёт инспектору основание переквалифицировать операцию. Результат — отказ в льготе или вычете, доначисление налога, штраф по статье 122 НК РФ: 20% при неумысле и 40% при умысле. Последнее не снижается через смягчающие обстоятельства.

Второй типичный сценарий — контрагент. ИФНС доначисляет НДС и налог на прибыль со ссылкой на то, что поставщик выполнял работы без лицензии, значит, реальность операции под сомнением. Здесь задействуется статья 54.1 НК РФ: уменьшение налоговой базы допустимо только если обязательство исполнено надлежащей стороной, а основной целью сделки не является неуплата налога.

Как ИФНС использует разрешительную документацию при ВНП?

Инспектор в рамках ВНП вправе истребовать документы в порядке статьи 93 НК РФ. Срок на представление — 10 рабочих дней. В перечень документов по лицензируемой деятельности, как правило, входят:

• Лицензии с указанием номера, даты выдачи, срока действия и перечня разрешённых работ
• Разрешения на ввод объекта в эксплуатацию, допуски СРО, свидетельства о соответствии требованиям
• Договоры на выполнение работ с указанием их вида и объёма
• Первичные документы: акты КС-2 / КС-3, накладные, счета-фактуры, сопоставимые с предметом лицензии
• Журналы производства работ, технические задания, проектная документация — всё, что подтверждает фактический вид деятельности

Инспекторы сопоставляют даты лицензий с датами договоров и первичных документов. Если лицензия получена позже, чем начаты работы, или срок её действия истёк до завершения объекта — этот разрыв становится основанием запроса, а затем — доводом в акте.

Акт ВНП составляется в течение двух месяцев с даты справки об окончании проверки. После вручения акта у налогоплательщика есть ровно один месяц на подачу возражений (статья 100 НК РФ). Срок не восстанавливается.

Когда «документы в порядке» не защищает от доначислений?

Большинство собственников убеждены: если лицензия есть и бухгалтерия её отражает — риска нет. Это заблуждение воспроизводится из цикла в цикл и ежегодно стоит компаниям десятков миллионов рублей доначислений.

Ниже — три конкретных ситуации, которые ИФНС разрабатывает при проверке лицензируемой деятельности.

Ситуация 1: лицензия есть, но виды работ расходятся

Ситуация. Строительная компания ведёт монтажные работы. В лицензии (или допуске СРО) перечислены конкретные коды видов работ. В договорах с заказчиками указаны смежные работы, формально не включённые в допуск.

Ключевые доказательства ИФНС. Сопоставление кодов в договорах и актах КС-2 с перечнем разрешённых работ. Показания технического директора на допросе о фактическом составе работ.

Вероятный исход. Переквалификация части выручки как «деятельность без лицензии»; отказ в льготе по НДС (если применялась); штраф 20% от суммы недоимки по статье 122 НК РФ.

Стратегия. До начала ВНП — аудит договоров на предмет соответствия кодам СРО. После получения акта — возражения с детальным анализом приложений к договорам и фактической документации.

Ситуация 2: льгота по НДС применена без полного комплекта разрешений

Ситуация. Медицинская организация применяет освобождение от НДС по перечню медицинских услуг. На часть услуг лицензия получена с задержкой на несколько месяцев; за этот период льгота применялась.

Ключевые доказательства ИФНС. Даты лицензий из реестра Росздравнадзора, сопоставленные с книгой продаж и датами актов оказанных услуг.

Вероятный исход. Доначисление НДС за «лицензионный разрыв» по ставке 20%; пени за каждый день просрочки; срок давности привлечения — три года с окончания налогового периода (статья 113 НК РФ).

Стратегия. Если разрыв фактически был, — акцент на смягчающие обстоятельства (задержка по вине лицензирующего органа, незначительный период, уплата налога до ВНП). Штраф 40% применяется только при доказанном умысле.

Ситуация 3: контрагент без лицензии — отказ в вычете НДС

Ситуация. Компания-заказчик привлекает субподрядчика для выполнения лицензируемых работ. Субподрядчик либо не имеет лицензии вовсе, либо срок её действия истёк до завершения работ.

Ключевые доказательства ИФНС. Данные реестра лицензий; отсутствие у субподрядчика персонала нужной квалификации; расчёты только через транзитные счета.

Вероятный исход. Отказ в вычете НДС и признании расходов по налогу на прибыль по статье 54.1 НК РФ. При сумме доначислений свыше 18,75 млн рублей за три года — уголовный риск по статьям 198–199 УК РФ.

Стратегия. Собрать доказательства реальности выполнения работ субподрядчиком — журналы, пропуска на объект, переписку, показания прорабов. Налоговая реконструкция возможна, если реальный исполнитель установлен и раскрыт.

Что нужно подготовить собственнику до начала ВНП?

Предпроверочный анализ — инструмент, который позволяет выявить уязвимости по лицензионной документации до того, как их обнаружит инспектор. Согласно данным ФНС, 98% ВНП завершаются доначислениями: это значит, что риски есть почти у каждой компании, — вопрос в их размере и управляемости.

Следующий минимальный чек-лист позволяет собственнику оценить уязвимость до начала проверки.

• Сверьте даты действия всех лицензий и разрешений с периодами, отражёнными в договорах и первичных документах
• Проверьте соответствие перечня разрешённых видов работ (коды СРО, виды по лицензии) фактическим кодам в договорах
• Запросите у ключевых субподрядчиков актуальные лицензии и выписки из реестра — на дату выполнения работ, не на текущий день
• Убедитесь, что льготы по НДС применялись только в периоды действия соответствующих лицензий
• Проверьте наличие документов, подтверждающих реальность выполнения лицензируемых работ: журналы, акты допуска на объект, переписка с заказчиком

Если по результатам этого анализа обнаружены разрывы — их устранение или документирование до прихода инспектора принципиально меняет переговорную позицию.

Решение ИФНС по итогам ВНП выносится в течение 10 рабочих дней после окончания срока на возражения и вступает в силу через месяц после вручения (статья 101 НК РФ). До вступления в силу — подаётся апелляционная жалоба в УФНС. После — обеспечительные меры: блокировка счёта по статье 76 НК РФ становится возможной автоматически.

Как результативность ВНП связана с лицензионными рисками?

98% выездных проверок по данным ФНС завершаются доначислениями — не потому, что все компании уклоняются от налогов. ИФНС назначает проверку только тогда, когда предпроверочный анализ уже указывает на конкретные расхождения. Для лицензируемых видов деятельности таким триггером часто служат данные АСК НДС-2 о разрывах в цепочке НДС у субподрядчиков.

Постановление Пленума ВАС РФ от 30.07.2013 № 57 закрепляет: нарушение процедуры ВНП — самостоятельное основание для отмены решения. Инспектор обязан соблюдать сроки, уведомлять о продлении, фиксировать основания для каждого приостановления. Контроль за этим — элемент защиты.

Налоговая реконструкция — ещё один инструмент. Письмо ФНС от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060@ устанавливает: если реальный исполнитель установлен и раскрыт, ИФНС обязана учесть фактически понесённые расходы даже при доначислении. По лицензионным эпизодам это означает: если работы реально выполнены, пусть и контрагентом с формальными проблемами с лицензией, — налоговая реконструкция снижает базу доначислений.