Счета-фактуры при ВНП: что проверяют

Как ФНС использует АСК НДС-2 до начала ВНП и в ходе проверки

До вынесения решения о назначении выездной проверки инспекция проводит предпроверочный анализ: строит цепочки НДС через АСК НДС-2 и выявляет разрывы — ситуации, когда поставщик не отразил реализацию, а покупатель заявил вычет. Поступления НДС в 2024 году составили 8,7 трлн рублей, а система ежегодно обрабатывает около 15 млрд строк счетов-фактур. При таком объёме разрыв на любом звене цепочки фиксируется автоматически.

В ходе ВНП инспекторы используют те же данные, но уже как доказательную базу. Счёт-фактура сверяется одновременно с тремя источниками: книгой покупок проверяемого лица, книгой продаж контрагента и декларацией по НДС. Расхождение по реквизитам — номеру, дате, сумме или ИНН — автоматически порождает требование пояснений. Если расхождение выявлено на уровне второго или третьего звена, инспекция запросит документы уже по всей цепочке через механизм встречных проверок.

Налоговый разрыв по НДС в России составляет менее 0,6% — один из самых низких показателей в мире. Это означает, что система не пропускает технические ошибки: любое несоответствие данных попадает в поле зрения инспектора до начала ВНП, а не в ходе неё.

Что именно проверяют в счёте-фактуре при ВНП?

Статья 169 НК РФ устанавливает перечень обязательных реквизитов счёта-фактуры. Дефекты, которые не мешают идентифицировать продавца, покупателя, товар, стоимость, ставку и сумму НДС, не являются основанием для отказа в вычете — это прямая норма пункта 2 статьи 169. Однако при ВНП инспекторы проверяют не только формальные реквизиты.

Фактически контроль делится на три уровня.

Первый уровень — формальный. Проверяется наличие всех обязательных реквизитов: наименование и ИНН сторон, адрес, номер и дата, описание товара или услуги, единица измерения, количество, цена, ставка и сумма НДС, подписи. Подпись неуполномоченного лица сама по себе не является основанием для отказа в вычете по норме пункта 3 статьи 54.1 НК РФ. Но она становится дополнительным доказательством нереальности операции, если инспекция уже собрала иные факты.

Второй уровень — сопоставительный. Счёт-фактура сверяется с первичными документами: товарной накладной, актом, транспортными документами, платёжными поручениями. Несовпадение дат, объёмов или наименований товара между счётом-фактурой и накладной — типичное основание для вопросов. Особое внимание — к документам на транспортировку: если товар физически перемещался, должны быть транспортные накладные или ТТН.

Третий уровень — содержательный. Здесь инспекция применяет критерии статьи 54.1 НК РФ: реальна ли операция, является ли снижение налоговой базы основной целью сделки, и исполнено ли обязательство надлежащей стороной. Письмо ФНС от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060@ ввело понятие «коммерческого стандарта» должной осмотрительности: недостаточно проверить контрагента по открытым реестрам — нужно фиксировать деловую переписку, полномочия подписанта, ресурсы исполнителя.

• Убедитесь, что счета-фактуры от крупных контрагентов подписаны действующими руководителями — сверьтесь с данными ЕГРЮЛ на дату подписания.
• Проверьте соответствие реквизитов счёта-фактуры и первичных документов: даты, суммы, наименования товара или услуги.
• Подготовьте документы, подтверждающие деловую цель сделки: коммерческие предложения, переписку, документы о выборе контрагента.
• Проверьте наличие транспортных документов там, где физическая поставка была обязательной частью сделки.
• Сформируйте досье на ключевых поставщиков: ресурсы, сотрудники, история взаимодействия.

Когда технические дефекты счёта-фактуры становятся основанием для доначисления?

Формальные нарушения редко становятся самостоятельным основанием для отказа в вычете. Судебная практика, включая позиции, закреплённые в Постановлении Пленума ВАС РФ от 12.10.2006 № 53 и Обзоре ВС РФ от 13.12.2023, устойчива: налогоплательщик действует добросовестно, пока не доказано обратное. Но дефекты документов создают условия для того, чтобы доказать обратное.

На практике отказ в вычете НДС строится на совокупности признаков. Инспекция фиксирует: разрыв в АСК НДС-2 по контрагенту, подпись в счёте-фактуре от имени лица, которое при допросе отрицает свою причастность, отсутствие транспортных документов при заявленной товарной поставке, адрес контрагента совпадает с адресом массовой регистрации. Каждый из этих фактов по отдельности — не доказательство. Их совокупность — уже достаточная доказательная база для акта ВНП по статье 100 НК РФ.

Штраф за неуплату НДС составляет 20% от суммы недоимки при отсутствии умысла и 40% при его наличии — статья 122 НК РФ. Умысел не снижается через смягчающие обстоятельства. Если инспекция квалифицирует ситуацию как умышленную — базовое доначисление 65 млн рублей превращается в 91 млн с учётом штрафа. Плюс пени.

Срок давности привлечения к ответственности по статье 113 НК РФ — три года со следующего дня после окончания налогового периода. При ВНП глубина проверки — не более трёх лет до года её назначения по статье 89 НК РФ. Это означает, что ошибки в счетах-фактурах трёхлетней давности вполне могут стать предметом доначисления в текущем году.

Типовые ситуации: как ФНС использует счета-фактуры в разных сценариях

Сценарий 1. Реальная операция, но документы оформлены через технического посредника

Ситуация. Компания приобрела товар у поставщика, который реально его поставил, но выступал посредником без фактической деловой роли — основным исполнителем был другой контрагент. Счёт-фактура выставлен от имени посредника, который не уплатил НДС.

Ключевые доказательства инспекции. Разрыв в АСК НДС-2 на уровне посредника, отсутствие у него сотрудников и складских мощностей, показания директора при допросе о номинальном характере своего участия.

Вероятный исход. Отказ в вычете НДС, доначисление плюс штраф 20%. Однако при доказанности реальности самой операции применяется налоговая реконструкция: расходы по налогу на прибыль сохраняются. Позиция закреплена в Обзоре ВС РФ от 13.12.2023.

Стратегия. Раскрыть реального исполнителя, предоставить документы о фактической поставке. Это основание для реконструкции и снижения доначислений.

Сценарий 2. Услуги, которые невозможно подтвердить первичными документами

Ситуация. Компания заявила вычет НДС по счетам-фактурам за консультационные, маркетинговые или иные услуги. Акты оказания услуг не содержат конкретного описания, переписка с исполнителем не сохранена, деловой результат документально не зафиксирован.

Ключевые доказательства инспекции. Формальность актов, невозможность установить конкретный результат услуги, отсутствие у исполнителя профильных специалистов. Сумма доначислений по таким эпизодам нередко составляет 10–30 млн рублей при объёме услуг 60–150 млн рублей.

Вероятный исход. Полный отказ в вычете НДС и исключение расходов из базы по налогу на прибыль. Штраф — 20 или 40% в зависимости от наличия умысла.

Стратегия. До начала ВНП — формировать детализированные отчёты по услугам и фиксировать деловой результат. В ходе проверки — предоставлять максимальный объём косвенных доказательств: электронную переписку, протоколы совещаний, внутренние распоряжения по итогам услуг.

Сценарий 3. Счета-фактуры охватывают период, по которому истекает срок давности

Ситуация. ВНП назначена в 2025 году, охватывает период 2022–2024 гг. Основная часть сомнительных операций приходится на 2022 год — крайний период проверки.

Ключевые доказательства инспекции. Счета-фактуры 2022 года от контрагентов с последующей ликвидацией, разрывы в АСК НДС-2 за тот же период.

Вероятный исход. Срок давности по статье 113 НК РФ — три года после окончания налогового периода. Для НДС IV квартала 2022 года срок истекает 01.01.2026. Если решение по итогам ВНП по статье 101 НК РФ вынесено до этой даты — штраф применим. После — только недоимка и пени. Разница может составить 8–15 млн рублей на одном эпизоде.

Стратегия. Контролировать даты вынесения решения и апелляционного обжалования. Обеспечительные меры — блокировка счёта по статье 76 НК РФ — применяются только после вступления решения в силу, поэтому апелляционная жалоба по статье 139.1 НК РФ даёт месяц отсрочки.

Как выстраивается позиция защиты при оспаривании вычетов?

Ключевой вопрос при оспаривании — не судиться или нет, а насколько обоснована позиция инспекции по каждому эпизоду. Судебная статистика по налоговым спорам: в 2024 году рассмотрено около 10 900 дел в первой инстанции, из них около 37% — в пользу налогоплательщиков по числу дел. При этом доля удовлетворённых требований в деньгах составляет 5–10% от заявленного. Это означает: выигрывают не все дела, а те, где доказательная база выстроена системно.

Позиция по счетам-фактурам строится на трёх направлениях. Первое — доказательство реальности операции: физическое перемещение товара, фактическое оказание услуги, результат, который использовался в деятельности компании. Второе — должная осмотрительность при выборе контрагента: документы, которые компания запрашивала до заключения договора, и их анализ. Третье — налоговая реконструкция: если операция реальна, но исполнена ненадлежащей стороной, расходы по налогу на прибыль сохраняются. Этот механизм закреплён в письме ФНС от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060@ и подтверждён Обзором ВС РФ от 13.12.2023.

Обеспечительные меры — в том числе блокировка счёта по статье 76 НК РФ — применяются после вступления решения в силу. Апелляционная жалоба по статье 139.1 НК РФ подаётся в течение одного месяца и автоматически откладывает вступление решения в силу. Это единственный способ сохранить операционную ликвидность на период обжалования.

Смежные материалы по теме:

• Как добиться налоговой реконструкции при доначислении
• Проценты за незаконное взыскание налога
• Как оформить доверенность на ведение ВНП