Пени при ВНП: как рассчитываются и можно ли снизить

Главный бухгалтер получает акт выездной проверки и видит в нём три строки: недоимка, штраф и пени. Пени — та часть, которую большинство воспринимает как фиксированную и неоспоримую. Это не так. По итогам 2024 года средний размер доначислений по одной ВНП составил 65 млн рублей по России и 101 млн рублей по Москве. Пени в типовом акте составляют 30–50% от суммы недоимки — то есть десятки миллионов рублей, и часть этой суммы оспаривается.

Инструкция ниже объясняет, как ИФНС считает пени при ВНП, где в расчёте чаще всего допускаются ошибки и какие правовые основания позволяют их снизить или обнулить. Четыре шага — от проверки базы начисления до подготовки возражений на акт.

Шаг 1. Проверьте базу начисления пеней

Пени начисляются на сумму недоимки — разницу между тем, что налогоплательщик должен был заплатить, и тем, что фактически уплатил в бюджет в установленный срок. Первый день начисления — следующий за датой, когда налог должен был быть перечислен. Последний день — дата фактической уплаты недоимки (включительно) или дата вынесения решения по ВНП.

В акте ВНП база для пеней формируется по каждому налогу и по каждому налоговому периоду отдельно. Главный бухгалтер должен проверить три параметра по каждой строке расчёта:

  • Сумма недоимки. Совпадает ли она с доначислением по акту. Если ИФНС применила налоговую реконструкцию — расчётный метод — база для пеней должна быть скорректирована на ту же сумму.
  • Дата начала начисления. Проверьте, что ИФНС не начала отсчёт раньше установленного срока уплаты налога за конкретный период.
  • Дата окончания начисления. Пени не начисляются за период моратория (если он действовал), а также за период, когда у налогоплательщика имелась переплата, перекрывающая недоимку.
  • Переплата в том же бюджете. Если в проверяемом периоде на том же КБК была переплата — недоимка для целей пеней уменьшается на её сумму.

На практике ИФНС нередко не учитывает переплаты, обнулённые зачётами по другим налогам. Это арифметическая ошибка, которая устраняется в возражениях на акт без судебного обжалования.

Шаг 2. Как рассчитать пени при ВНП самостоятельно?

Ставка пеней для организаций зависит от длительности просрочки. За первые 30 календарных дней недоимки применяется 1/300 ключевой ставки Центрального банка за каждый день. Начиная с 31-го дня — 1/150 ключевой ставки. Это правило действует с 2017 года и применяется к недоимкам, возникшим после 01.10.2017.

Формула для одного отрезка с неизменной ключевой ставкой:

  • Пени = Недоимка × Ставка ЦБ × (1/300 или 1/150) × Количество дней

Если за период начисления ключевая ставка менялась — расчёт ведётся отдельно по каждому отрезку действия конкретной ставки. Это ключевой источник ошибок в расчётах ИФНС: при нескольких изменениях ставки за три года проверки количество отрезков может превышать двадцать. Любой из них — потенциальная ошибка.

Пример из практики: при ВНП за 2021–2023 годы ключевая ставка менялась более пятнадцати раз. ИФНС применяла среднее значение вместо поотрезочного расчёта. Разница на недоимке 20 млн рублей составила около 800 тысяч рублей — в пользу бюджета. Это основание для снижения пеней в возражениях.

Получили акт ВНП с доначислениями и пенями?

Если ИФНС вручила акт выездной проверки — у вас один месяц на подачу возражений (пункт 6 статьи 100 НК РФ). Этот срок не восстанавливается. Юристы VINDEX проверят расчёт пеней, выявят арифметические ошибки и подготовят возражения с правовой аргументацией по каждой строке доначислений.

Оспорить выводы налоговой

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram

Шаг 3. Какие основания позволяют снизить или обнулить пени?

Пени — не штраф. К ним не применяются смягчающие обстоятельства из статьи 112 НК РФ. Однако существуют три правовых основания, при которых пени снижаются или не начисляются вовсе.

Основание 1. Разъяснения Минфина или ФНС. Если налогоплательщик действовал в соответствии с письменными разъяснениями Минфина России или ФНС, адресованными неопределённому кругу лиц, пени за недоимку, образовавшуюся вследствие следования таким разъяснениям, не начисляются. Это прямо предусмотрено подпунктом 3 пункта 1 статьи 111 НК РФ. Главному бухгалтеру нужно зафиксировать в возражениях: какое именно разъяснение применялось, за какой период, и что оно было общедоступным на момент принятия решения.

Основание 2. Налоговая реконструкция. Если ИФНС доначислила налог без учёта реальных расходов налогоплательщика на приобретение товаров или услуг, сумма недоимки завышена. Письмо ФНС от 10.03.2021 № БВ-4-7/3060@ требует учитывать расходы и вычеты, которые налогоплательщик понёс в действительности, даже если контрагент признан техническим. Снижение недоимки автоматически уменьшает базу для пеней.

Основание 3. Процессуальные нарушения при ВНП. Постановление Пленума ВАС РФ от 30.07.2013 № 57 закрепляет: существенное нарушение процедуры проверки — основание для признания решения недействительным. Если решение ИФНС отменено судом по процессуальным основаниям, пени отменяются вместе с ним. Типичные нарушения: рассмотрение материалов без надлежащего уведомления налогоплательщика, использование доказательств, полученных за пределами ВНП.

Срок давности привлечения к ответственности по статье 113 НК РФ составляет три года. Пени, однако, начисляются за весь период недоимки независимо от этого срока — до момента её фактического погашения. Поэтому снижение самой недоимки через реконструкцию выгоднее, чем попытка оспорить только пени.

Важно: штраф по статье 122 НК РФ за неуплату налога составляет 20% при отсутствии умысла и 40% при наличии умысла. Умысел не снижается через смягчающие обстоятельства. Это делает борьбу за квалификацию нарушения отдельным и критически важным направлением работы при получении акта ВНП.

Шаг 4. Подготовьте возражения на акт ВНП

Возражения на акт выездной проверки подаются в ИФНС, проводившую проверку, в течение одного месяца со дня вручения акта — это требование пункта 6 статьи 100 НК РФ. Срок не продлевается и не восстанавливается. Возражения, поданные после его истечения, формально не рассматриваются до вынесения решения.

По пеням в возражениях следует разделить два блока:

  • Арифметический блок: перерасчёт по каждому налогу и периоду с приложением собственной таблицы начислений. Если ИФНС допустила ошибку в ставке или в дате начала — разница фиксируется в рублях.
  • Правовой блок: ссылка на основание для снижения (разъяснение Минфина, реконструкция, процессуальное нарушение) с указанием нормы и судебной практики.

После вынесения решения по итогам проверки оно вступает в силу через один месяц со дня вручения, если не подана апелляционная жалоба в УФНС — это правило статьи 101 НК РФ. Апелляционная жалоба — обязательный досудебный этап. Подавать её следует через ту же ИФНС, которая вынесла решение.

Если обеспечительные меры — блокировка счетов по статье 76 НК РФ — введены одновременно с вынесением решения, срок на их обжалование составляет десять дней. Это самостоятельное процессуальное действие: блокировку счёта можно оспорить даже до того, как само решение обжаловано по существу.

Типовые ситуации: главный бухгалтер и пени при ВНП

Ситуация 1. Главбух с полным доступом к «1С» и первичным документам.

ИФНС вызывает на допрос и запрашивает выгрузки из учётных систем. Доказательная база строится на данных, которые главный бухгалтер сам же вёл. В такой ситуации ключевой вопрос — соответствие данных «1С» первичным документам. Если расхождений нет — это аргумент против обвинений в умысле. Штраф 40% по статье 122 НК РФ в таких делах оспаривается именно через снятие квалификации умысла: доначисление сводится к 20%, пени при этом не меняются, но итоговая сумма снижается существенно. Стратегия: разделить арифметические ошибки ИФНС и содержательные разногласия.

Ситуация 2. Главбух без реального доступа к налоговым решениям.

Схемы согласовывались финансовым директором или собственником. Главный бухгалтер вёл только учёт, решений о выборе контрагентов не принимал. В такой ситуации важно зафиксировать должностные инструкции и ограниченность полномочий до начала допросов. Если ФНС попытается квалифицировать действия как умышленные — отсутствие полномочий на принятие управленческих решений снимает этот тезис. По делам в Сибирском ФО (осень 2023) именно разграничение полномочий позволило снять обвинение в умысле, штраф снижен с 40% до 20%, пени рассчитаны по пониженной недоимке после реконструкции.

Ситуация 3. Главбух-совместитель при ограниченной занятости.

Ведёт учёт нескольких компаний, полной картины по каждой не имеет. ИФНС использует это как аргумент против реальности деятельности. Здесь пени зависят от того, признают ли операции реальными: если ВНП охватывает три года и сумма доначислений составляет 30 млн рублей, пени могут превысить 10 млн рублей при ставке 1/150 ключевой ставки. Стратегия: доказать реальность операций через деловую переписку и товарные потоки — снятие недоимки устраняет пени автоматически.

Кейс 1. ВНП производственной компании, Уральский ФО, лето 2023. ИФНС доначислила НДС и налог на прибыль на общую сумму 38 млн рублей, пени — 14 млн рублей. Главный бухгалтер запросил собственный пересчёт пеней и выявил ошибку: ИФНС применяла единую ставку 1/150 ко всему периоду, не разбивая его на отрезки по 30 дней. По результатам возражений пени снижены на 3,2 млн рублей без судебного обжалования. Недоимка оспорена отдельно через налоговую реконструкцию.

Кейс 2. ВНП торговой компании, Северо-Западный ФО, весна 2024. Акт содержал пени за период, когда у налогоплательщика числилась переплата по НДС на том же КБК — 6 млн рублей. ИФНС переплату не учла. Главный бухгалтер зафиксировал факт переплаты по данным лицевого счёта и подготовил возражения с приложением выписки. Пени за этот период — около 900 тысяч рублей — исключены из решения. Срок реакции от получения акта до подачи возражений составил 18 рабочих дней.

Налоговая ещё не предъявила претензий — самый подходящий момент для анализа

Если ВНП назначена, но акт ещё не вручён — предпроверочный анализ позволяет выявить позиции, по которым ИФНС с высокой вероятностью доначислит налоги и пени. Один месяц на возражения после вручения акта — срок, который не восстанавливается. Юристы VINDEX проведут анализ зон риска и разработают стратегию защиты документооборота на период проверки.

Подготовиться к выездной проверке

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram

Направления практики по теме

Смотрите также: Базы данных ФНС: что видит инспектор о компании, Налоговый суд: как подготовить доказательственную базу, Реконструкция в апелляции: аргументы для УФНС. Актуальные материалы по налоговым проверкам — в разделе Аналитика по налоговым проверкам.

Частые вопросы

1. Сколько длится ВНП?

Выездная налоговая проверка длится два месяца с даты вынесения решения о её назначении. По основаниям, установленным статьёй 89 НК РФ, срок продлевается до четырёх месяцев, в исключительных случаях — до шести. Сверх того, ВНП может приостанавливаться суммарно на срок до шести месяцев — на время истребования документов у контрагентов или проведения экспертиз. Фактическая длительность с учётом приостановлений нередко превышает год.

2. Можно ли приостановить ВНП?

Приостановить ВНП вправе только сам налоговый орган по основаниям, перечисленным в пункте 9 статьи 89 НК РФ: истребование документов у контрагентов, проведение экспертизы, перевод иностранных документов. Налогоплательщик инициировать приостановление не может. На период приостановления инспекторы обязаны покинуть территорию компании и вернуть изъятые оригиналы документов.

3. Что проверяет ФНС?

В рамках ВНП налоговый орган проверяет правильность исчисления и своевременность уплаты налогов, указанных в решении о назначении проверки, за период не более трёх лет, предшествующих году проверки. На практике большинство ВНП охватывают НДС и налог на прибыль — они формируют около 90% доначислений. ИФНС вправе запрашивать документы, проводить допросы, осмотры и выемку.

4. Как подготовиться к ВНП?

Подготовка к ВНП включает аудит документооборота по крупнейшим контрагентам за три года, анализ налоговых разрывов по НДС в АСК НДС-2, инструктаж сотрудников перед возможными допросами и назначение единого координатора взаимодействия с проверяющими. Предпроверочный анализ позволяет выявить уязвимые позиции до того, как ИФНС их зафиксирует в акте.

5. Когда ФНС назначает выездную проверку?

ФНС назначает ВНП на основе предпроверочного анализа: оценки налоговой нагрузки ниже среднеотраслевой, высокой доли вычетов по НДС, убыточности в нескольких периодах, признаков дробления или работы с техническими компаниями. Решение о назначении ВНП принимается, когда налоговый орган накапливает достаточную доказательную базу для результативной проверки — результативность ВНП в 2024 году составила 98%.

Пени при ВНП — управляемая статья доначислений. Ошибки в расчёте ставки, неучтённые переплаты и необоснованная база снижаются через возражения на акт без судебного обжалования. Налоговая реконструкция, устраняющая часть недоимки, одновременно уменьшает и пени. Месяц на возражения после получения акта — единственное окно для этой работы.

Практика VINDEX включает более 300 дел по сопровождению ВНП и подготовке возражений на акты проверок. Специализация — налоговые споры от стадии предпроверочного анализа до арбитражного суда.

Есть ситуация с пенями по ВНП, которую хотите разобрать?

Оценим расчёт ИФНС и скажем, есть ли основания для снижения. Рейтинг Право-300 · 15+ лет практики сети.

Оценить налоговые риски

+7 (383) 310-38-76  |  +7 (983) 510-38-76  |  WhatsApp  |  Telegram  |  info@vitvetbiz.ru

Автор статьи

Артём Борисов, аналитик-эксперт

Специализация — налоговые споры в арбитражных судах: апелляция, кассация, представительство в ФАС округов и ВС РФ. Формирует процессуальную стратегию по делам с суммой доначислений от 50 млн рублей.

12 июня 2026 года